Địa bàn xã Liên Hoa hiện nay trước đây vốn là hai xã Hoa Nam và Hoa Lư thuộc huyện Đông Hưng.

Trước khi sáp nhập, xã Hoa Lư có diện tích 3,30 km², dân số là 3.000 người, mật độ dân số đạt 909 người/km², gồm 5 thôn: An Bài, Kim Bôi, Lễ Nghĩa, Nguyên Lâm, Tân Lập.

Xã Hoa Nam có diện tích 3,18 km², dân số là 2.988 người, mật độ dân số đạt 940 người/km², có 4 thôn: An Lễ, Vạn Thắng, Chiến Thắng, Thống Nhất.

Ngày 11 tháng 2 năm 2020, Ủy ban Thường vụ Quốc hội ban hành Nghị quyết số 892/NQ-UBTVQH14 về việc sắp xếp các đơn vị hành chính cấp xã thuộc tỉnh Thái Bình (nghị quyết có hiệu lực từ ngày 1 tháng 3 năm 2020)[1]. Theo đó, sáp nhập toàn bộ diện tích và dân số của hai xã Hoa Nam và Hoa Lư thành xã Liên Hoa.